在当今社会，无证经营现象时有发生。对于此类行为，政府相关部门通常会采取一系列措施进行处理，其中一项重要的措施就是没收违法所得。本文将探讨无照经营的定义、如何认定违法所得以及没收程序等问题。

首先，我们要明确无照经营的概念。无照经营是指经营者在未取得营业执照或相关行政许可的情况下，擅自从事经营活动的行为。这种行为违反了国家有关工商管理的法律法规，扰乱了正常的市场秩序，对合法经营者和消费者权益造成损害。因此，国家对无照经营持严厉打击态度。

其次，要理解违法所得的概念。违法所得是指经营者通过无照经营所获得的收入。这部分收入并非合法所得，而是因违反法律法规而产生的非法收益。在实际操作中，确定违法所得的具体数额是一个复杂的过程，需要结合经营者的账簿记录、银行流水、销售记录等多种证据来综合判断。

那么，当有关部门认定某经营者存在无照经营行为，并且有违法所得时，该如何进行没收呢？根据我国相关法律法规的规定，没收违法所得应当遵循法定程序。具体来说，可以分为以下几个步骤：

第一步，调查取证。有关部门在接到举报或者发现线索后，应当及时开展调查工作。这包括但不限于查阅经营者账簿、询问相关人员、调取银行流水等。只有掌握了充分的证据，才能认定经营者存在违法所得。

第二步，作出决定。在完成调查取证之后，有关部门应当依法作出没收违法所得的决定。这一决定应当明确指出违法所得的具体数额，并告知当事人不服该决定时可采取的救济途径。

第三步，执行没收。在作出没收决定后，有关部门应当按照法律规定的方式执行没收程序。这可能包括直接从经营者账户中扣划款项，或者要求经营者限期缴纳等。

最后，需要注意的是，在没收违法所得的过程中，必须保障当事人的合法权益。例如，当事人有权陈述自己的意见，有权申请复议或者提起诉讼等。同时，有关部门也应当遵循公平公正的原则，确保没收过程合法合规。

总之，无照经营不仅违反了国家法律法规，还严重扰乱了市场经济秩序。因此，对于此类行为，相关部门必须依法予以查处，并没收其违法所得。同时，在整个过程中，也要充分尊重当事人的合法权益，确保执法活动的合法性与合理性。